На факультете инженерных систем и экологии создана научно-педагогическая школа «Брестская гидрологическая школа» под руководством доктора географических наук РФ и РБ, профессора, лауреата премии Национальной академии наук 2007 года Александра Александровича Волчека. В результате своей деятельности она обеспечивает участие молодых ученых и студентов в государственных научных программах, НИР, НИРС, их подготовку к проводимым на республиканском и международном уровнях конкурсам и олимпиадам, защитам диссертаций. Так четверо ее воспитанников (Ан.А.Волчек, Т.А.Шелест, Д.Н.Дашкевич, И.В.Бульская) удостоены стипендии Президента Республики Беларусь во время обучения в аспирантуре. В настоящее время состав научной школы насчитывает 16 исследователей, из них: 1 доктор географических наук, 4 кандидата технических наук, 3 кандидата географических наук, 5 аспирантов, 2 соискателя.

В научно-исследовательской лаборатории «Пульсар» под руководством профессора, доктора технических наук Виталия Степановича Северянина и кандидата технических наук, доцента Владимира Геннадьевича Новосельцева активно ведутся исследования в области инженерных систем и нетрадиционной энергетики. Опубликовано более сотни научных трудов, разработки защищены более чем двумястами патентами на изобретения и полезные модели. Результаты исследований внедрены в учебном процессе, производстве, докладывались на многих конференциях.

Научная школа «Разработка перспективных технологий
и сооружений для очистки природных и сточных вод», руководителем научной школы является профессор кафедры водоснабжения, водоотведения и охраны водных ресурсов, кандидата технических наук, доцент Житенёв Борис Николаевич. Внедрены акты в учебный и производственный процесс.

В ходе научной работы студенты и сотрудники факультета инженерных систем и экологии выполняют научные программы, постоянно участвуют на конференциях как внутри страны, так и за рубежом. Основные темы исследований: оценка влияния современного изменения климата на речной сток, разработка современных экологических фасадных и интерьерных красок, разметочный материал, проблемы биокоррозии при реставрации дворца Пусловских в г. Коссово, моделирование уникальных конструкторских решений совместно с кафедрой строительных конструкций и т.д.